Powodem zgagi nie jest obecność bakterii Helicobacter pylori. Zgaga jest wynikiem cofania się treści żołądkowej do przełyku. Zgaga bywa zjawiskiem fizjologicznym. Jednak gdy epizody jej stają się coraz dłuższe i nie ustępują w ciągu dnia to uznaje się to za wskazanie do wykonania gastroskopii. Będzie można wówczas stwierdzić, czy za przykrym uczuciem palenia w przełyku nie stoi np. przepuklina rozworu przełykowego. Lekarz oceni dolną część przełyku i odpowie na pytanie, czy nie stwierdza się tam stanu zapalnego. Pobrane zostaną wycinki do badania histopatologicznego i na podstawie konkluzji patomorfologa oraz skojarzenia jej z objawami klinicznymi u chorego będzie można podjąć decyzję, co do dalszego postępowania.