W celu wykonania ablacji do serca wprowadzona zostaje specjalna elektroda. Elektrodę wprowadza się, poprzez naczynia (zwykle udowe: tętnicę lub żyłę udową); końcówka elektrody rozgrzewana prądem o częstotliwości radiowej (stąd nazwa ablacja RF - radio frequency do około 60 stopni Celsjusza) „wypala” ognisko, będące źródłem arytmii.

Skuteczność zabiegu zależy od rodzaju i lokalizacji podłoża arytmii. Po zabiegu należy kilka godzin leżeć, przez tydzień należy oszczędzać nakłutą nogę i nie wykonywać wysiłków czy zbyt długich marszy. Nie wolno też pochylać się i wykonywać przysiadów, aby uniknąć późnego krwawienia z nakłutej żyły lub tętnicy. Powikłania: krwiak, powikłania zakrzepowo-zatorowe, infekcje, przebicie ścian naczyń lub serca, odma opłucnowa, krwawienie do osierdzia, przejściowy lub trwały blok przedsionkowo-komorowy.